Στο Κύπελλο ΕΠΣΘ ο Ρήγας Φεραίος και προαιρετικά οι Νέοι της κάθε ΠΑΕ

Μέχρι και την περυσινή περίοδο (2012- 2013), οι ομάδες της Γ' Εθνικής κατηγορίας συμμετείχαν στο Κύπελλο Ελλάδας (μαζί με τις ομάδες της πρώην Α' και Β' Εθνικής), όμως πλέον δε θα ισχύει κάτι τέτοιο, όπως αποφάσισε η ΕΠΟ. Η νέα Γ' Εθνική διαμορφώνεται σε ερασιτεχνική κατηγορία, και ως γνωστό παύει να είναι επαγγελματική και ό,τι αυτό συνεπάγεται. Σύμφωνα με το νέο ΚΑΠ που έχει επισημοποιηθεί, οι ομάδες της Γ' Εθνικής θα συμμετέχουν στο Κύπελλο Ερασιτεχνών της Ένωσής του κάθε nομού που ανήκουν, και το οποίο διοργανώνουν οι οικείες τοπικές ΕΠΣ. Προβλέπεται επίσης στο Κύπελλο της κάθε Ένωσης, μπορεί να λάβει μέρος προαιρετικά και η ερασιτεχνική ομάδα της κάθε ΠΑΕ που συμμετέχει στη Β΄ Εθνική (δηλαδή η ερασιτεχνική ομάδα κάθε σωματείου που έχει ιδρύσει ΠΑΕ). Περισσότερα αναμένονται να διευκρινιστούν στη προκήρυξη του Πρωταθλήματος της Β' και Γ' Εθνικής. Όσον αφορά στο Κύπελλο ΕΠΣΘ, φέτος δήλωσαν συμμετοχή 29 ομάδες.